Während anderswo, wie zum Beispiel bei der Biennale São Paulo, nationale Länderpräsentation schon seit langem aufgegeben worden sind, bleiben sie in Venedig neben der zentralen internationalen Ausstellung, konzipiert von einem künstlerischen Leiter, nach wie vor ein wesentlicher Bereich. In den letzten Jahren kamen sogar weitere nationale Pavillons hinzu. Seit Ende 2010 sind zwischen den Veranstaltern der Biennale und einzelnen Ländern Vereinbarungen für die Einrichtung und Nutzung permanenter Pavillons in den Sale d'Armi und anderen Teilen des Arsenale getroffen worden, wofür diese sich an den Restaurierungskosten des Gebäudekomplexes beteiligen müssen. Andere Länder, Regionen oder Institutionen mieten temporärer Orte in der Stadt, darunter viele historische Palazzi.

Im Januar 2020 wurde der italienische Filmproduzent Roberto Cicutto zum neuen Präsidenten der Biennale di Venezia ernannt. Sein Vorgänger Paolo Baratta war Präsident der Biennale seit 2008 und davor von 1998 bis 2001.

Seit 1998 bestehen die Ausstellungen der Sektionen Kunst und Architektur nicht mehr nur aus den nationalen Präsentationen, sondern aus diesen drei Hauptbereichen:
- Nationale Pavillons mit eigenem Kurator und Konzept
- Internationale Ausstellung, kuratierte von einem dafür von der Biennale benannten Kurator
- kollateralen Veranstaltungen, bestätigt vom Kurator der Biennale